커스터마이징 영역이 skin 폴더내 라면 

스킨을 유지하고 업데이트를 하시는게 맞습니다.

그외 코어 파일이라면 백업을 해두시고 업데이트를 해보는게 가장 좋은 방법일거같네요.

정확히 어느 디렉토리에 있는 어떠어떠한 파일을 건드셨는지 알려주시면 보다 정확한 답변을 받아보실수있으실겁니다.

안녕하세요~^^

무료로 포함된 기본 스킨을 그대로 커스터마이징 해서 사용하고 있다면 현재 스킨을 유지하고 업데이트를 하셔야 할 듯합니다.

저희는 기본 스킨을 직접 커스터마이징 하는 것을 권장하지 않고 있습니다.

대신 스킨 폴더를 복사해서 커스터마이징 하시는 게 좋습니다.

예를 들어 default 스킨을 복사해서 default2 스킨을 만드신 다음 커스터마이징을 진행하시는 겁니다.

또한 CSS 아이디 혹은 클래스 이름이 겹치지 않게 변경해주시는 게 좋습니다.

고맙습니다.